蘇州醫(yī)工所在結(jié)構(gòu)光照明超分辨顯微成像技術(shù)研究與儀器研制中獲進展
眾所周知,直接觀察的光學(xué)顯微鏡對細(xì)胞生物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、免疫學(xué)、病理藥理學(xué)等生物醫(yī)學(xué)研究具有重要意義。但受到衍射極限的限制,傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的分辨率理論上只能達到光波長的一半。較長時間以來,超分辨熒光顯微成像技術(shù)的出現(xiàn)有效打破了光學(xué)衍射極限的束縛;趩畏肿佣ㄎ患夹g(shù)的超分辨顯微鏡(SMLM)和受激發(fā)射損耗顯微鏡(STED)以及結(jié)構(gòu)光照明超分辨顯微鏡(SIM)等技術(shù)在眾多課題組的努力下都得到了長足發(fā)展,尤其是結(jié)構(gòu)光照明顯微鏡具有成像速度快、光毒性小、無須特殊熒光標(biāo)記等優(yōu)勢,已成為生命科學(xué)領(lǐng)域尤其是活細(xì)胞成像中很受歡迎的一種技術(shù)手段。近期,中國科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所李輝課題組圍繞結(jié)構(gòu)光照明超分辨顯微成像方法、高保真SIM重構(gòu)算法、國產(chǎn)化的SIM顯微鏡研制等研究,取得了一系列重要進展。 三維成像方法因能夠獲取更多的生物樣品信息而備受關(guān)注。然而,現(xiàn)有的三維成像不可避免地帶來離焦模糊和時間分辨率差的問題,不易用于對樣品的快速三維動態(tài)成像。為了實現(xiàn)對厚樣品的快速三維成像,李輝課題組發(fā)展出基于數(shù)字微鏡陣列器件(DMD)和液體變焦透鏡(ETL)的結(jié)構(gòu)光照明層切顯微技術(shù),并開發(fā)出基于兩張原始圖像的層切成像算法。該方法將傳統(tǒng)的三維層切成像的速度提高了數(shù)倍以上,課題組利用該技術(shù),對斑馬魚和大腦血管的心血管系統(tǒng)進行了高速動態(tài)成像,清晰地顯示了心臟跳動期的收縮-舒張過程以及腹部血管的蠕動特性。相關(guān)研究成果以Four-dimensional visualization of zebrafish cardiovascular and vessel dynamics by a structured illumination microscope with electrically tunable lens為題,發(fā)表在Biomedical Optical Express(2020)上,其中,博士生陳沖為論文第一作者。 結(jié)構(gòu)光照明超分辨成像技術(shù)在多種納米尺度的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)研究中已得到廣泛應(yīng)用,但對于具有大動態(tài)范圍的樣本(如聚集的細(xì)胞囊泡),樣品中熒光較強的聚集性區(qū)域和亮度較弱的稀疏區(qū)域不能同時呈現(xiàn),F(xiàn)有的SIM方法針對這種樣品無法重建出高質(zhì)量的圖像。對此,李輝課題組提出了一種采用多重曝光采集的高動態(tài)SIM成像方法HDR-SIM,采集三組不同強度照明的SIM圖像,然后融合出一幀超分辨圖像。利用HDR-SIM,強度相差400多倍單個和聚集的熒光小球樣本在同一張SIM超分辨圖中可同時觀察到,并且對分辨率不會產(chǎn)生影響。在使用該方法觀測不同尺度的細(xì)胞囊泡結(jié)構(gòu)時,單個小囊泡和大的囊泡聚集均可同時獲得清晰的分辨。相關(guān)研究成果以High Dynamic Range Structured Illumination Microscope Based on Multiple Exposures為題,發(fā)表在Frontiers in Physics(2021)上,其中,梁永為論文第一作者。 ![]() 圖1.基于兩張正反圖像的結(jié)構(gòu)光照明層切算法(左);斑馬魚心臟跳動過程的快速三維成像(右) ![]() 圖2.高動態(tài)SIM成像原理(左);“聚集-單個”的熒光小球高動態(tài)SIM成像(右) ![]() 圖3.高保真結(jié)構(gòu)光照明超分辨成像重建算法HiFi-SIM(左);細(xì)胞結(jié)構(gòu)HiFi-SIM與其他算法重建結(jié)果比較(右) ![]() 圖4.插件式結(jié)構(gòu)光照明超分辨成像系統(tǒng) 在結(jié)構(gòu)光照明成像過程中,超分辨圖像重建算法尤為關(guān)鍵。SIM重建算法的一些固有缺陷造成超分辨圖像中常出現(xiàn)重構(gòu)偽影,使SIM圖像的保真度經(jīng)常受到質(zhì)疑,并且圖像重建時需要完成一系列復(fù)雜的參數(shù)設(shè)定,限制著普通用戶對SIM技術(shù)應(yīng)用。李輝課題組開發(fā)出一種基于點頻譜優(yōu)化的高保真SIM重建算法。該算法克服了常規(guī)SIM算法易產(chǎn)生重構(gòu)偽影且光學(xué)層切能力差的問題,對不同質(zhì)量原始數(shù)據(jù)的處理均能獲得具有極少偽影和良好光學(xué)層切的高質(zhì)量超分辨圖像,有效提高了SIM成像的保真度。同時,該算法對OTF失配和用戶自定義參數(shù)不敏感,使用生成的理論OTF和較少的參數(shù)即可重構(gòu)高質(zhì)量SIM圖像,降低了SIM成像對實驗實施和后處理重構(gòu)的高要求,提升了算法對普通用戶的友好度。相較于幾種傳統(tǒng)的SIM算法,HiFi-SIM算法對多種不同圖像質(zhì)量、不同樣品復(fù)雜度、不同圖像來源(商用設(shè)備/自主搭建SIM系統(tǒng))的原始數(shù)據(jù)進行重建, HiFi-SIM均展現(xiàn)出最少的重建偽影和最優(yōu)的圖像質(zhì)量。相關(guān)研究成果以High-fidelity structured illumination microscopy by point-spread-function engineering為題,發(fā)表Light: Science & Applications(2021)上,其中,文剛為論文第一作者。 李輝課題組自2014年以來一直專注于SIM成像的技術(shù)創(chuàng)新、儀器研發(fā)和應(yīng)用推廣,開發(fā)出多種形式的結(jié)構(gòu)光照明顯微鏡系統(tǒng)。近期,基于課題組最新的研究成果,研發(fā)出一套可集成于顯微鏡下層光路的結(jié)構(gòu)光照明插件,具有結(jié)構(gòu)緊湊、方便易用等特點。插件可配置國產(chǎn)倒置熒光顯微鏡,實現(xiàn)了SIM超分辨成像系統(tǒng)的國產(chǎn)化替代。首臺機器已于近期交付某大學(xué)用戶進行試用。 |