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我國科研團隊在同步輻射單細胞紅外顯微成像研究中獲進展

發(fā)布:cyqdesign 2020-12-22 12:21 閱讀:3221
單細胞技術因有望揭示“細胞功能異質性機制”這一生命科學的本質問題,從而解析各種慢性疾。ㄈ绨┌Y、糖尿病和神經退行性疾。┖退ダ系姆肿踊A,是當前生物醫(yī)學的研究熱點和重點方向。單細胞技術在測序方面取得了進展;由于該技術具有無須標記、非侵入性、可同時展示胞內代謝物(組)特征等優(yōu)點,逐漸得到學界關注。近期,中國科學院上海高等研究院研究員呂軍鴻課題組先后與上海生物信息技術中心、納米技術及應用國家工程研究中心、首都醫(yī)科大學天壇醫(yī)院、濱州醫(yī)學院、上海交通大學瑞金醫(yī)院等的科研人員合作,在單細胞紅外成像技術的數據處理方法、單細胞表型組、干細胞異質性等研究中取得系列進展,相關研究成果陸續(xù)發(fā)布在Chemical Communications和Analytical Chemistry上。 }}AIpYp,P  
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針對不同批次處理和測量時,引入的與生物狀態(tài)不相關的系統(tǒng)性技術偏差這一單細胞技術的共性問題,研究人員從紅外光譜數據離散向量化、質控與預處理、特征選取等環(huán)節(jié)入手,發(fā)展了一種對單細胞紅外光譜相似性進行評判的方法,并在不同類型、不同狀態(tài)的細胞光譜分析中得到了驗證,為分析單細胞紅外光譜數據提供了實驗基準和理論依據。相關研究成果以How many cells are enough for single-cell infrared spectroscopy為題,發(fā)表在Chemical Communications上(圖1)。 2bp@m;g$  
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圖1.批次效應對單細胞紅外光譜數據的影響與評價方法的建立
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人類表型組是基因組之后生命科學研究的又一重點,是聯系生物體基因型和表型的橋梁。當前,單細胞表型分析(single cell phenotyping)得到的參數較少,不易精確反映生物樣品的全貌。研究人員利用紅外光譜,可同時靈敏地獲得細胞多種構成成分結構信息及其微小變化的特點,通過統(tǒng)計分析大量單細胞光譜數據,在國際首次提出單細胞紅外表型組(Single Cell Infrared Phenomics)的概念和表型分析策略;利用該技術方法,實現了對低濃度中藥成分作用下腫瘤細胞的反應評價,從而使作用靶點不明情況下的藥物篩選成為可能,也將為人類表型組研究提供全新手段。相關研究成果以Single-cell infrared phenomics: phenotypic screening with infrared microspectroscopy為題,發(fā)表在Chemical Communications上(圖2)。 /4:bx#;A  
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