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北大開發(fā)混合物理模型與深度學(xué)習(xí)的結(jié)構(gòu)光超分辨重構(gòu)算法

發(fā)布:gangzi0801 2023-02-21 22:47 閱讀:1725
近年來(lái),超分辨率熒光顯微鏡的發(fā)展極大地推動(dòng)了人類對(duì)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的研究。其中,基于結(jié)構(gòu)光照明的超分辨率熒光顯微鏡(SR-SIM)憑借其光子轉(zhuǎn)化效率高等優(yōu)點(diǎn),非常適合活細(xì)胞的超分辨率成像。然而,北京大學(xué)陳良怡實(shí)驗(yàn)室2018年的工作提出,盡管結(jié)構(gòu)光的光子轉(zhuǎn)化成為超分辨的效率比其他類型的超分辨率顯微鏡更高,但是由于它存在的反卷積重建過(guò)程會(huì)放大圖像中噪聲產(chǎn)生偽影,從而影響超分辨率圖像的可信度和定量化分析。在其提出利用時(shí)空連續(xù)性作為先驗(yàn)知識(shí)開發(fā)的基于海森正則化項(xiàng)的迭代重建方法后,其他許多研究組也開發(fā)了不同的抑制偽影的方法。已有的基于物理模型或通用先驗(yàn)知識(shí)的方法能夠抑制噪聲導(dǎo)致的偽影,但背景失焦引起的蜂窩狀偽影、光照散射引起的偽影等不能完全抑制。而深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)重建方法雖然能夠更好地抑制重建超分辨率圖像導(dǎo)致的各種偽影,但可能會(huì)產(chǎn)生局部失真和分辨率降低。 _j>L4bT  
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2023年1月,北京大學(xué)未來(lái)技術(shù)學(xué)院陳良怡教授團(tuán)隊(duì)結(jié)合了物理模型和深度學(xué)習(xí)兩種重建方法的優(yōu)點(diǎn),通過(guò)利用全深度變分(TDV)網(wǎng)絡(luò)作為重構(gòu)目標(biāo)函數(shù)的正則化項(xiàng),將其與SIM物理模型相結(jié)合,提出了一種混合重建方法(TDV-SIM),能夠在抑制偽影的同時(shí)保持分辨率。在處理不同細(xì)胞結(jié)構(gòu)的圖像時(shí),TDV-SIM較單純的深度學(xué)習(xí)方法能夠更好地保留真實(shí)信號(hào),同時(shí)比基于物理模型的方法能夠更有效地去除偽影。相關(guān)工作以題為“Hybrid reconstruction of the physical model with the deep learning that improves structured illumination microscopy”(doi:10.1117/1.APN.2.1.016012)的論文發(fā)表于Advanced Photonics Nexus上。 F~'sT}A*  
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