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上海有機(jī)所開發(fā)出四維代謝組學(xué)精準(zhǔn)分析技術(shù)Met4DX

發(fā)布:cyqdesign 2023-04-18 14:26 閱讀:488
中國科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心研究員朱正江課題組在《自然-通訊》(Nature Communications)上,在線發(fā)表了題為A mass spectrum-oriented computational method for ion mobility-resolved untargeted metabolomics的研究論文。該工作針對基于離子淌度質(zhì)譜的四維代謝組學(xué)技術(shù)開發(fā)了一種端到端的精準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析技術(shù)Met4DX,用于四維代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的四維峰檢測、峰對齊和峰定量,并結(jié)合四維數(shù)據(jù)庫實(shí)現(xiàn)代謝物的四維精準(zhǔn)匹配和鑒定(圖1)。 +5k^-  
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離子淌度質(zhì)譜相較于傳統(tǒng)質(zhì)譜增加了根據(jù)離子尺寸、形狀以及電荷分離的離子淌度,有效提升了質(zhì)譜的分離能力,特別是代謝物同分異構(gòu)體的分辨能力,其跟液相色譜聯(lián)用形成多維分離分析技術(shù),可進(jìn)一步提高復(fù)雜生物樣本分析的分離度和峰容量。一次四維代謝組學(xué)分析能夠同時對代謝物離子進(jìn)行四個維度的表征,包括精確質(zhì)量數(shù)(MS1)、二級質(zhì)譜圖(MS/MS)、色譜保留時間(RT)和離子淌度碰撞截面積(CCS),能有效提升對復(fù)雜生物樣品中代謝物定性和定量分析的覆蓋度和準(zhǔn)確度。然而,四維代謝組數(shù)據(jù)的高度復(fù)雜性對數(shù)據(jù)的高效精準(zhǔn)分析提出了挑戰(zhàn),尤其是四維質(zhì)譜峰的檢測仍是難點(diǎn)。因此,四維代謝組數(shù)據(jù)分析技術(shù)和工具相對有限。目前,少量工具如MS-DIAL與MZmine等均采用自上而下壓縮數(shù)據(jù)的降維策略進(jìn)行峰檢測。該降維策略可以降低數(shù)據(jù)的維數(shù)和復(fù)雜性,但降維過程也不可避免低引入了信號掩蔽及干擾,顯著降低了四維峰檢測的靈敏度。 dU"ca|u  
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