科學家發(fā)現(xiàn)迄今最大海洋細菌:能從陽光中獲取能量
據(jù)國外媒體報道,科學家在海水樣本中發(fā)現(xiàn)迄今最大的海洋細菌,它能夠從太陽光線中獲取能量。幾年前,一臺價值80萬美元的高精密醫(yī)用熒光活性細胞分選儀懸掛在起重機上,準備裝載到海洋研究船,與此同時,海洋微生物生態(tài)學家亞歷山德拉·沃登(Alexandra Worden)和同事們準備在大西洋起航,收集單細胞真核生物,并單獨隔離進行單細胞全基因組測序。此次海洋研究活動還在太平洋尋找古生菌、細菌和其他與微生物有關的有機體,沃登和同事希望采集海水樣本帶回實驗室分析,但這種做法將潛在地會影響樣本的生物多樣性,他們最終決定將實驗室搬到了勘測現(xiàn)場。
研究人員正在收集海水樣本,作為調(diào)查海洋單細胞真核生物和與之相關的有機體的一部分。 起重機操作非常順利,細胞分選儀也安全上船,科研人員和船員們開始了航海之旅,他們采集了海水樣本,用熒光染色細胞制成食物液泡,標記那些積極進食的生物體,并將海水樣本送入細胞分選儀,從中篩選出熒光染色細胞,結(jié)果顯示被篩選出來的絕大多數(shù)是領鞭毛類細胞,即以細菌為食的掠食性真核生物。之后研究小組除了對原核生物基因組排序之外,還在領鞭毛類細胞中尋找細菌和古生菌,沃登稱,起初我們并未獲得什么發(fā)現(xiàn),但我們?nèi)匀粚@項海洋勘測十分熱衷。 海洋勘測活動結(jié)束之后,博士后大衛(wèi)·尼德姆(David Needham)決定挖掘冷凍海水樣本,從而確定是否存在細菌,結(jié)果尼德姆發(fā)現(xiàn)了迄今海洋中最大的細菌,以及第二種感染掠食性原生生物的細菌。沃登說:“通過尋找普通的微生物候選者,我們最初忽略了一種重要細菌,其具有獨特的組合結(jié)構(gòu)! 目前,這種海洋中最大的細菌被命名為“ChoanoVirus”,它具有8.7萬個堿基,該細菌基因組很大,其蛋白質(zhì)編碼尤其令研究人員感到興奮。在數(shù)以百計的蛋白質(zhì)序列中,沃登帶領的研究團隊發(fā)現(xiàn)了3種視紫紅質(zhì)——這是存在于人體等生物體內(nèi)某些細胞膜中的光處理受體,例如視網(wǎng)膜需要視紫紅質(zhì)才能看到物體。這種細菌基因組還將β-胡蘿卜素分子與酶物質(zhì)合成在視網(wǎng)膜中,β-胡蘿卜素在視紫紅質(zhì)中還起到光敏處理作用。相比之下,人類和大多數(shù)真核生物存在部分視紫紅質(zhì)機制,必須從外部資源獲取β-胡蘿卜素形成視網(wǎng)膜。 為了發(fā)現(xiàn)這些細菌視紫紅質(zhì)在領鞭毛類宿主體內(nèi)的可能性作用,研究人員在大腸桿菌中表達了細菌序列,并且發(fā)現(xiàn)光線會觸發(fā)蛋白質(zhì),開始泵送質(zhì)子?赡艽嬖诘那闆r是,這些細菌實際上是在幫助細胞從太陽中獲取能量,沃登說:“這種情況是在捕食性細胞中絕對預想不到的,它是一種具有新功能的細菌,其功能并不存在于宿主生物體內(nèi)! 某些生物體利用視紫紅質(zhì)從太陽光線中產(chǎn)生化學能,這并不是一項最新發(fā)現(xiàn),幾十年前,科學家曾報道稱,嗜鹽古生菌(halophilic archaea)利用視紫紅質(zhì)產(chǎn)生能量。2000年,沃登的研究同事埃德·德朗(Ed DeLong)曾指出,海洋細菌利用視紫紅質(zhì)捕獲光能。此后海洋生物學家在海洋多種微生物中發(fā)現(xiàn)了這種奇特的新陳代謝方式,2019年,沃登帶領研究人員分析了海水樣本中視紫紅質(zhì)含量豐度,并估測在海洋某些區(qū)域,視紫紅質(zhì)從太陽光線中獲取的能量比葉綠素獲取的更多。 這項最新研究首次表明,細菌明顯具有掠奪性單細胞生物的功能。研究人員猜測,當有機質(zhì)缺乏的時候,領鞭蟲類生物會通過視紫紅質(zhì)機制獲得能量,或者幫助它們加速新陳代謝。 這項研究結(jié)論讓我們試圖了解宿主體致病影響之外的感染過程,或許ChoanoViruses和其他細菌具有一些生存優(yōu)勢,它們不是感染宿主并溶解細胞來傳播更多的細菌,這個概念在人類病毒學領域獲得了支持,但在海洋領域還是一個新概念,此前海洋細菌獲得的科學關注較少。迄今為止,科學家已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有間接證據(jù)表明海洋細菌與宿主之間存在共生關系。 |